乙肝抗病毒治疗是乙肝治疗的核心内容，抗病毒治疗是一个长期艰巨的任务，评价治疗效果需要从短期效应到持久效应、从个别项目与整体指标改善、从部分应答到完全应答等几方面综合判定。
(一)单项应答
1病毒学应答指血清乙肝病毒DNA检测不到(PCR法)或低于检测下限，或较基线下降大于2.log10。一般来说使用核苷类抗病毒药物，绝大多数乙肝患者可以获得病毒学应答。
2血清学应答指血清乙肝病毒e抗原转阴或出现乙肝病毒e抗原与e抗体的血清学转换；或乙肝病毒表面抗原转阴或出现乙肝病毒表面抗原与表面抗体的血清学转换。一般来说：e抗原与e抗体的血清学转换有可能通过抗病毒获得，但是难度较大，正确使用干扰素类或核苷类抗病毒药物治疗有可能使40％左右的患者获得这样的有效应答。表面抗原与表面抗体的血清学转换是乙肝治疗的终极目标，但是依照目前治疗水平，完成这个目标尚不现实，极少有患者可以达到这个目标。
3生化学应答指血清谷丙转氨酶和谷草转氨酶恢复正常。这个目标相对容易达到，转氨酶的高低变化很容易受到药物因素的影响，是判断疗效的次要指标。
4组织学应答指肝脏组织学炎症坏死或纤维化程度改善达到某一规定值。组织学检查是对肝脏内部实际情况的直接洞察，也是判断治疗效果的“金指标”，它可以了解到肝组织炎症坏死、肝纤维化以及病毒数量、复制状态以及病毒的分布形式，组织学的改善是治疗效果最真实的体现。因此肝组织学检查最好能在治疗初始阶段和治疗终点进行对比研究。
(二)时间顺序应答
1初始或早期应答治疗12周时的应答。治疗抗病毒治疗往往要持续1年以上时间，治疗3个月左右可以进行1次小结，看看病毒指标是否有变化，如果病毒载量明显下降，预示着以后的结果会比较满意，如果病毒载量反而上升，预示着治疗结局不好，应该调整治疗方案。
2治疗结束时应答整个疗效结束后，综合判断各项指标的改善情况。
3持久应答治疗结束后随访6个月或12个月以上，疗效维持不变，无复发。这一点非常重要，乙肝抗病毒的暂时效应并不难达到，但是要想获得持久应答确是不易办到的，如果患者治疗获得理想的效果，并且可以持续1年以上时间，这预示着未来病情有可能得到真正的控制和好转。
4维持应答在抗病毒治疗期间表现为乙肝病毒DNA检测不到(PCR法)或低于检测下限，或肝功能正常。
5反弹达到了初始应答，但在未更改治疗的情况下，过了一段时间后，乙肝病毒DNA水平重新升高，或一度转阴后又转为阳性，可伴有或不伴有转氨酶升高。使用拉米夫定治疗半年左右，往往效果明显，但是一年之后，陆续发生“反弹”现象，主要是病毒变异和耐药的结果。
6复发达到了治疗结束时应答，但停药后乙肝病毒DNA重新升高或转阳。这是乙肝病毒由于目前各种抗病毒药物对于乙肝病毒的核心成分cccDNA都没有清除作用，只是抑制了病毒复制的一些环节，停药后，病毒复制模板再次启动，病情就会复发。
(三)联合应答
1完全应答乙肝病毒e抗原阳性患者，治疗后肝功能恢复正常，乙肝病毒DNA检测不出(PCR法)和出现乙肝病毒e抗原与e抗体的血清学转换；乙肝病毒e抗原阴性患者，治疗后肝功能恢复正常，乙肝病DNA检测不出(PCR法)。肝脏组织学炎症坏死或纤维化程度改善。这是抗病毒治疗较为理想的目标，但是获得这样一个结果并不容易。
2部分应答介于完全应答与无应答之间。如乙肝病毒e抗原阳性患者，治疗后肝功能恢复正常，乙肝病毒DNA转阴，但没有出现乙肝病毒e抗原与e抗体的血清学转换。这种情况下抗病毒治疗不能中断，仍需继续用药或联合用药，希望获得完全应答。
3无应答未达到以上应答者。
综上所述，乙肝抗病毒治疗可能会带来许多不同的结果，最佳的抗病毒治疗效果应该是持久的完全应答，但是只有少数患者可以获得这样的疗效，绝大多数患者都会出现部分应答、早期应答、以及无应答、反弹和复发等不甚理想的结果。正确应用抗病毒治疗以及正确和客观评价抗病毒疗效非常重要，尤其是在让患者充分理解和配合抗病毒治疗期间。
