《兴化县志》说他自幼聪明，才华横溢，工诗文，擅书画。尝为诸生，颇有名望。但早岁事举子业，九试而不中，于是弃儒学道，入山隐居。数次遇异人，得受仙道秘诀。后声言吕洞宾降临其北海草堂，住二十二日，亲授丹诀。

关于此次遇仙奇遇，其《金丹就正篇·自序》说：“嘉靖丁末，偶以因缘遭际，得遇法祖吕公于北海之草堂，弥留款洽”，“嗣后常至其家。……既以上乘之道勉进潜虚，并授以结胎之歌，入室之旨，及吕公自记数十则，终南山人集十卷。……研寻二十载，流光如箭，甲子嘉平（阴历十二月）潜虚乃遁于荒野……遂大感悟，由是入室求铅，不数载而事毕。”又称：“甲子嘉平，……复感恩师示梦，去彼挂此，遂大感悟。追忆曩所授语，十得八九；参以契论经歌，反覆紬绎，寤寐之间，性灵豁畅，恍若有得，乃作是篇。”陆西星认为自己深得吕洞宾真传，故著书立说，阐发内丹之旨，开内丹东派，被后世道教尊为内丹东派之祖。

陆西星的思想颇具代表性，他提出了“性命双修，

明嘉靖二十六年丁未（1547年），二十八岁。于本年秋季，与姚四溟“同被师眷”，在北海草堂遇吕祖（吕洞宾）传授

明嘉靖二十七年戊申（1548年）二十九岁。据《三藏真诠》记载，是年得到了吕祖及刘海蟾的传授。

明嘉靖二十九年庚戌（1550年）三十一岁。为“衣食奔走，与师契阔”数年。

明嘉靖三十三年甲寅（1554年）三十五岁。西星外出归乡。明嘉靖三十四年乙丑（1555年）三十六岁。兴化水灾，西星困穷，拾取水中穗穧以充饥。但仍然研究丹法不辍。

明嘉靖三十五年丙辰（1556年）三十七岁。研究丹法，多有所遇。

明嘉靖三十六年丁巳（1557年）三十八岁。其时倭寇犯浙江、福建，人皆仓惶而走，独西星念老母年迈，不肯远走。

明嘉靖三十七年戊午（1558年）三十九岁。嘉靖三十七年、三十八年、三十九年连续三年，西星皆客居金台。

明嘉靖己未三十八年（1559年）四十岁。同学赵宋中进士，赵宋累官至宁武兵备副使、山西行太仆寺卿，为官守正

在此篇序言中写道：“甲子嘉平，予乃遁于荒野，览镜悲生，二毛侵鬓，慨勋业之无成，知时日之不待。复感恩师示梦，去彼挂此，遂大感悟，追忆囊所授语，十得八九。参以契论经歌，反复紬绎，寐寐之间，性灵豁畅，恍若有得，乃作是篇。孔子曰：‘温故而知新。’今予所温者故也，而所知则新也。虽一时臆度之言，未敢就正有道，然亦庶几不背吾师之旨乎！”

陆西星是两宋、元明道教房中术及内丹双修理论的集大成者。他对《参同契》、《遇真篇》、《阴符》等的阐释，颇有超过宋元注释之处。他主张阴阳同类双修，认为“男女阴阳之道顺之则生人，逆之则成丹”。并撰成《七破论》，抨击其他炼养之术。在金丹命术方面主张“真火无候、大药无斤”，不应拘泥于繁琐法度。

陆西星著作另有《金丹就正篇》一卷，为道教内丹学史上第一篇有关双修问题的专论。《玄肤论》一卷，是内丹学通论，讨论了诸如三元丹法之相互关系，内外丹之划分，先后天之区别，修性了命之联系等一系列至关重要的理论问题。以及《老子道德经玄览》等。收入《方壶外史》。晚年参禅，又作《楞严述旨》十卷，《楞严经说略》一卷。

一些学者对封神演义作者疑存，认为是陆西星著。据清·无名氏《传奇汇考》卷七“《顺天时》传奇解题”云：《封神传》传系元时道长陆长庚所作，未知的否？张政烺在《〈封神演义〉漫谈》一文中，据此认为陆西星是《封神演义》作者，“元