1976年1月，出生于黑龙江省集贤县。

1991年09月—1995年07月，在陕西第一工业大学（今陕西国防工业职业技术学院）中专学习。

1995年07月—1998年07月，获全国高等教育自学考试本科学历。

1998年09月—2001年02月，在沈阳工业大学学习，获硕士学位。

2001年02月—2005年04月，在哈尔滨工业大学控制科学与工程专业学习，获博士学位。

2005年09月—2007年10月，在加拿大阿尔伯塔大学（UniversityofAlberta）从事博士后研究。

2003年11月—2004年08月，任香港大学助理研究员（ResearchAssociate）。

2004年11月—2005年08月，任哈尔滨工业大学讲师。

2005年，入选教育部新世纪优秀人才支持计划。

2005年08月起，任哈尔滨工业大学教授。

2008年，获国家杰出青年科学基金资助。

2009年01月起，任哈尔滨工业大学智能控制与系统

高会军教授在网络控制的计算与滤波等方面做出了突出贡献。（中国新闻网评）

高会军凭借坚韧、执着、顽强的信念、不懈的努力把一座座山峰踩在脚下，创造了许多不可思议的奇迹；应学习他勇于拼搏、奋发图强的精神，努力攀登科技高峰。（西安电子科技大学空间科学与技术学院执行院长李小平评）

高会军为中国控制科学的发展及国际影响作出了重要贡献。（《中国教工》评）

高会军以勤奋自强的精神和坚韧不拔的毅力，经过十年的努力，从一个中专生成长为一个博士毕业生。30岁时，他成为哈尔滨工业大学最年轻的博士生导师；他潜心钻研，锐意创新。（《中国青年报》评）