闵珪为浙江承宣布政使司湖州府乌程县（今浙江湖州）人，于明英宗天顺八年（1464年）成进士，与李东阳等同年。及第后授官御史，出京巡按河南，以行事果决著称。

成化六年（1470年），闵珪擢拔为江西按察副使，再升为广东按察使。许久之后，以都察院右佥都御史巡抚江西。江西各府盗患严重，多有强宗家仆为盗的情况。闵珪请求抓获盗贼后，连坐其主人，法司今要听从。但贰臣尹直等联同宠臣李孜省，取来明宪宗中旨，责备闵珪不能平昔盗乱，将其贬为广西按察使。

明孝宗即位后，闵珪升任都察院右副都御史，巡抚顺天府。入朝拜刑部右侍郎。进右都御史。

弘治五年（1492年），闵珪升任都察院右都御史、两广总督，与总兵官毛锐出兵镇压古田僮族起事。副总兵马俊、参议马铉自临桂（今属广西桂林）深入，兵败战死，官军撤退。孝宗下诏停止俸给，命闵珪等平叛赎罪。闵珪重新进兵，连破七寨，余党全部就擒。

弘治七年（1504年），改任南京刑部尚书，不久再度入朝，

闵珪著有《闵珪文集》十卷。

朱祐樘：朕亦知珪老成不易得，但此事（指吴一贯案）太执耳。

谷应泰《明史纪事本末》：当是时，冰鉴则有王恕、彭韶；练达则有马文升、刘大夏；老成则有刘健、谢迁；文章则有王鏊、丘濬；刑宪则有闵珪、戴珊。

次女：闵氏，嫁潘夔，生潘季驯。

闵氏一门官运亨通，闵珪的从孙闵如霖，官至南京礼部尚书；闵如霖曾孙曾孙闵洪学，官至吏部尚书；闵洪学从弟闵梦得，兵部戎政尚书。