中平四年（184年），黄巾起义爆发。于禁由鲍信招募参与讨伐黄巾军。

初平三年（192年），鲍信迎曹操领兖州牧，于禁与其党俱封为都伯，属将军王朗。王朗异之，向曹操推荐于禁之才可任大将。曹操召见于禁，拜军司马。

初平四年（193年），曹操让他统兵到徐州，攻打广戚，攻克广威之后，任命他为陷陈都尉。

兴平元年（194年），随同曹操到濮阳讨伐吕布，于禁单独率兵在城南攻破了吕布两座营寨，又率兵在须昌打败了高雅。随从曹操攻打寿张、定陶、离狐,在雍丘包围了张超，占领了四座城池。又随曹操讨伐黄巾军刘辟、黄邵等部，屯扎在版梁。黄邵等乘夜袭击曹操营寨，于禁领部下迎击，打败了黄巾军，斩杀黄邵等，迫使黄巾军全部投降。

同年，从围袁术部将桥蕤、张勋等于若县，斩其四将。

建安二年（197年），于禁随曹操至宛，张绣投降。旋即张绣复叛，曹操的阵营被张绣军队忽然袭击，应付来不及，便各自退兵，非常混乱。唯独于禁约束部下，且战且退。一些士卒

曹操：①淯水之难，吾其急也，将军在乱能整，讨暴坚垒，有不可动之节，虽古名将，何以加之！②武力既弘，计略周备，质忠性一，守执节义，每临战攻，常为督率，奋强突固，无坚不陷，自援枹鼓，手不知倦。又遣别征，统御师旅，抚众则和，奉令无犯，当敌制决，靡有遗失。论功纪用，宜各显宠。

虞翻：禁败数万众，身为降虏，又不能死。北习军政，得禁必不如所规。还之虽无所损，犹为放盗，不如斩以令三军，示为人臣有二心者。

《魏书》：樊城之败，水灾暴至，非战之咎。

司马懿：禁等为水所没，非战守之所失。

陈寿：①太祖建兹武功，而时之良将，五子为先。于禁最号毅重，然弗克其终。②禁持军严整，得贼财物，无所私入，由是赏赐特重。然以法御下，不甚得士众心。

裴松之：围而后降，法虽不赦；囚而送之，未为违命。禁曾不为旧交希冀万一，而肆其好杀之心，以戾众人之议，所以卒为降虏，死加恶谥，宜哉。

陈叔宝：李陵矢竭，不免请降，于禁水涨，犹且生获，固知用兵上术，

子：于圭，在于禁死后嗣封益寿亭侯的爵位。

在小说《三国演义》中，于禁于曹操招贤之时前来投奔

赤壁之战中，曹操中周瑜之计误斩水军都督蔡瑁、张允，于禁和毛玠因而代替二人成为水军都督。赤壁兵败之后，于禁随曹操征讨马超、韩遂，于阵前不敌马超而败北。关羽率军攻樊城时，于禁、庞德奉命前往援救镇守樊城的曹仁，于禁因恐庞德与己争功而屡次牵制庞德，并拒绝庞德的建议于低地扎营，终被关羽以水攻大败。战后于禁被俘，向关羽乞降，被押解往荆州。吕蒙攻陷荆州后于禁被送往吴国，孙权降魏后将其释放返魏，奉命守护曹操陵墓。曹丕遣人将于禁战败乞降等事画于陵壁，于禁看后惭愧发病而死。

1994

《三国演义》

薛勇

1999

《曹操》

蔡明

2010

《三国》

吴刚